مقارن با سفر معاون محترم علمی و فناوری ریاست جمهوری، جناب آقای دکتر سورنا ستاری به استان خوزستان در تاریخ 21 خرداد ماه 1398،  تفاهم نامه همکاری میان این معاونت و دانشگاه صنعتی جندی شاپور دزفول امضا شد. بر این اساس مقرر گردید که مجتمع فناوری و نوآوری جندی شاپور در محل این دانشگاه راه اندازی شود. امور اولیه مربوط به تخصیص فضا و محل مورد نیاز انجام شد و در نتیجه در محل دانشگاه، مساحت بیش از 740 مترمربع سوله، جهت استقرار مجتمع فناوری و نوآوری اختصاص یافت.
مجتمع فناوری و نوآوری جندی شاپور دزفول با هدف تدوین مأموریت‌ها و سیاست‌هایی در خصوص چشم‌اندازهای دانشگاه صنعتی جندی شاپور دزفول در حوزه کارآفرینی، فناوری و نوآوری و رسالت این دانشگاه به عنوان یک دانشگاه کارآفرین در حوزه جنوب غرب کشور، تأسیس شده است.